Le Comité de Pilotage est l’organe d’orientation stratégique et de décisions du PPDU.

Il est composé de neuf (09) membres représentant les parties prenantes du PPDU. Sa  composition est la suivante :

• deux (02) Représentants de la Commission de la CEDEAO ;
• un (01) Représentant de la Banque d’Investissement et de Développement de la CEDEAO (BIDC) ;
• deux (02) membres représentant les Etats membres de la CEDEAO ;
• trois (03) membres représentant les Partenaires Techniques et Financiers ;
• un (01) membre représentant le Secteur Privé .

La Présidence du Comité de Pilotage est assurée par l’un des Représentants de la Commission de la CEDEAO. Le Vice-président est élu par ses pairs.

Les membres du Comité de Pilotage sont des personnes reconnues pour leurs compétences techniques et managériales. Le Directeur du PPDU assiste aux sessions  du Comité de Pilotage sans voix délibérative.